第一篇基础理论。给出涉农企业进行农产品物流与供应链管理的基础理论和研发架构。包括，一、农产品物流与供应链管理演化；二、从农产品物流与供应链相关管理者的视角出发，界定的农产品内涵、分类，以及定价方法和策略，构成了农产品物流与供应链中的农产品相关理论，达到区分出农产品供应链特性的目的；三、以系统决策树的方法，主要从核心企业的视角，阐述企业进行农产品物流与供应链管理的基本框架，以企业规划的表达方式，给出了企业进行农产品物流与供应链管理战略规划的时机、内容和方法，在战略实施方面，定义了企业供应链战略实施对应的所有契约形成的企业供应链商业模式，使得农产品企业的管理者更容易明确企业物流与供应链管理的工作；四、农产品供应链商业模式，明确了基本概念，阐述了该模式的协调激励机制理论基础，梳理了具有协调机制契约的农产品企业构建供应链商业模式方法。

第二篇农产品物流的企业管理篇。针对涉农物流企业运营中的主要运输和配送问题，提供物流成本与盈利模式换算的决策依据。包括，明确了农产品市场经营企业面对的主要物流问题：农产品最初一公里，农产品干线仓储布局与干线运输问题，农产品最后一公里问题。以此展开：农产品市场经营企业的集货决策、农产品干线仓储布局与干线运输决策、农产品库存与配送决策。

第三篇企业的农产品供应链管理篇。针对涉农企业的如下问题：一是用标准规范满足消费者进行农产品价格、品质主张与选择的依据，二是给出信息智能化发展换农产品盈利的供应链管理方法，三是基于安全和品控的视角，针对大宗粮食和生鲜农产品，提供与设施相配套的供应链管理方法，四是基于绿色发展的约束，提供现有的农产品供应链集成策略，五是在中国全球化发展的环境下，如何经营跨国农产品供应链集成管理。形成：基于良好操作规范的农产品供应链管理、电子商务环境下企业农产品供应链管理、粮食供应链和生鲜农产品供应链管理、基于循环经济的农产品供应链管理和跨国农产品供应链管理。