微生物高通量数据分析入门
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更新日期：2025/07/15
| 开课平台 | 爱课程（中国大学MOOC） |
|---|---|
| 开课高校 | 浙江大学 |
| 开课教师 | 马斌 |
| 学科专业 | 农学自然保护与环境生态类 |
| 开课时间 | 2020/10/05 - 2020/12/31 |
|---|---|
| 课程周期 | 13 周 |
| 开课状态 | 已结课 |
| 每周学时 | - |
课程简介
学习微生物生态不懂高通量测序？——Out了！
高通量测序分析太难不知怎么开始学？——No Worries!
本课程将从零基础开始介绍微生物高通量测序的发展历程、基本原理和常用方法。通过全面的讲解和实例的解析，解决微生物高通量测序是什么、做什么和怎么做的问题。高通量测序技术更新迅速、新方法层出不穷，通过本课程的学习，能够为学员以后的进阶学习夯实基础，达到触类旁通的目的。
课程大纲
测序技术的发展
1.1测序技术的发展
R语言基础
2.1R语言简介
2.2R语言数据类型
2.3RStudio简介
2.4tidyverse包简介
数据可视化（一）
3.1用ggplot做数据可视化
3.2ggplot2常用代码
数据可视化（二）
4.1ggplot2主题方案简介
4.2ggplot2颜色方案简介
扩增子测序
5.1扩增子测序分析
5.2uparse简介
微生物生态学分析方法
6.1常用的微生物生态学分析方法
6.2排序分析
6.3phyloseq简介
6.4ggtree简介
微生物生态网络分析
7.1微生物生态网络分析
7.2cytoscape简介
7.3gephi简介
7.4igraph简介
散弹枪测序和宏基因组
8.1散弹枪测序和宏基因组
1.1测序技术的发展
R语言基础
2.1R语言简介
2.2R语言数据类型
2.3RStudio简介
2.4tidyverse包简介
数据可视化（一）
3.1用ggplot做数据可视化
3.2ggplot2常用代码
数据可视化（二）
4.1ggplot2主题方案简介
4.2ggplot2颜色方案简介
扩增子测序
5.1扩增子测序分析
5.2uparse简介
微生物生态学分析方法
6.1常用的微生物生态学分析方法
6.2排序分析
6.3phyloseq简介
6.4ggtree简介
微生物生态网络分析
7.1微生物生态网络分析
7.2cytoscape简介
7.3gephi简介
7.4igraph简介
散弹枪测序和宏基因组
8.1散弹枪测序和宏基因组
关
注
我
们